Исследования бесклеточной ДНК помогли разработать метод диагностики, который стал известен как «жидкая биопсия»: при его помощи можно определить и мониторить некоторые виды рака, аномалии плода, а также оценить функцию трансплантированных органов.
Несмотря на многообещающий потенциал таких тестов, в настоящее время диапазон их применения ограничен. В новом исследовании американские ученые показали, как можно преодолеть эти ограничения и расширить сферу применения «жидкой биопсии». Их подход опирается на анализ образцов фрагментированной клеточной ДНК в сравнении с бесклеточной при различных физиологических условиях.
Специалисты из университета Вашингтона и медицинского института Говарда Хьюза представили в журнале Cell новые данные, описывающие процесса инновационного анализа структуры, называемы нуклеосомами. Нуклеосомы состоят из белкового ядра, вокруг которого намотана ДНК, как нить вокруг катушки. Нуклеосомы растянуты по всей длине генома, но каждая новая подобная структура выглядит несколько иначе, ем предыдущая, и эти различия могут оставить свой след в бесклеточной ДНК.
Используя множество образцов крови, полученных от больных раком, исследователи показали, что различные виды рака оставили различные нуклеосомные «отпечатки» в бесклеточной ДНК. В случае некоторых видов рака исследователи даже смогли определить анатомический источник опухоли. Это тест может быть особенно полезным в 5 % метастатических раковых опухолей, источник которых определить другими методами невозможно.